突破液相基因芯片三大关键技术节点，伯科生物高品质DNA合成技术助力基因检测行业发展

2021-09-26
南方医学网讯：近期，2021基因检测行业高峰论坛成功举办。伯科生物COO张明荣在会上发表了名为“高品质DNA合成技术在基因测序中的应用”的主题演讲。

伯科生物科技有限公司首席运营官张明荣


国产化的高通量核酸合成技术


DNA合成和测序是相辅相成的两个技术。伯科生物是依托于DNA合成技术的工具平台企业，在无锡建立了自己的GMP厂房，建立了ISO9001、ISO13485质量认证体系；于2020年获得“国家高新企业”认证；目前伯科生物的技术及产品已经被100多家医学检验机构和医院及学术机构使用，广泛受到用户的欢迎和一致好评。

张明荣表示，伯科生物的业务已经涵盖在基因测序中用到的所有核酸产品，包括测序接头引物、液相基因芯片探针和测序接头封闭试剂等，建立了多层次、多平台、多维度的质控体系。尤其在探针引物合成方面，伯科生物可以实现DNA探针引物的直接合成，无需转录和扩增，有效避免了扩增可能带来的偏好性。


张明荣表示，目前伯科生物的液相基因芯片产品线涉及了DNA、RNA、甲基化和病原体等应用方向，在性能方面可以比肩国外产品，同时支持多平台个性化定制（illumina测序平台、MGI测序平台、Nanopore测序平台）；伯科生物已经为国内外用户提供了超过100款定制化液相基因芯片，交付周期均控制在7~15个工作日内，目前已经实现最快3个工作日完成交付，真正兑现了本土化优势，加速相关领域的科研和临床转化。



智能设计平台


液相基因芯片开发的首要环节是探针设计。伯科生物经过“试验-学习”反复验证，基于自有的探针数据库，开发了适用于人类多组学液相基因芯片的探针设计平台。在设计中会同时考虑GC平衡、探针补偿效应区域等复杂因素。根据液相基因芯片不同应用方向的需求（肿瘤、遗传病、病原），在性能和覆盖区域有一些权衡的时候，我们都会人工校对。



三个关键技术节点


在液相基因芯片的生产过程中存在三个关键技术节点。**个是高通量、高效率的长链DNA合成技术，伯科生物拥有国内**的高通量核酸合成与修饰技术，能够高效、稳定地合成120nt的寡核苷酸探针用于液相基因芯片的生产，单碱基耦合效率大于99.5％，技术已达国际领先水平；第二个是低位阻生物素修饰，在目标基因捕获的实验中会影响捕获效率，伯科生物拥有自主知识产权的创新型生物素修饰技术，可以调节DNA结合的空间位阻，在提升探针与DNA的亲和能力和减少非特异结合方面具有独特的优势；第三个就是高分辨率的分离纯化，伯科生物经过不断试验，通过大量实验数据的验证，开发了**的双向纯化技术，可以保障液相基因芯片生产中的探针高纯度。



明星产品 TargetCap   Core Exome Panel v3.0


2020年9月，伯科生物发布了首款全流程国产的人全外显子捕获芯片，性能可以比肩国外产品，打破了海外巨头的垄断。性能参数和国际**产品相当；可以适配illumina和MGI测序平台；支持灵活添加区域；批次间性能参数稳定；支持多样本杂交捕获，节约成本；支持1h、4h快速杂交试验方案；支持批量样本处理的高通量实验方案。


用户独立测评


目前已经有多家国内外基因检测机构对伯科生物的液相基因芯片做了独立测评，包括全外显子和定制化液相基因芯片。从批次差异、捕获效率、覆盖均一性、突变检出、重点区域覆盖均一性、不同类型样品等多个角度分析比较，伯科生物的产品在性能参数方面都已经跨入世界**行列。


张明荣还表示，在交付使用的过程中，团队踏踏实实抱着精益求精的态度为合作伙伴服务，为基因检测行业服务，一个项目一个口碑，一个用户一个口碑。在国产替代的进程中，伯科生物还将继续依托特有的技术和平台，严格把控质量体系，不断增强创新能力，开发更多符合市场需求的产品。
会议基因检测
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