《病原精准诊疗前沿》专栏
第三期
时至21世纪,感染性疾病仍是导致人类死亡的主要原因之一。随着分子生物学技术的快速发展,病原精准检测的创新与应用成为了关注热点。微远基因专注于基因技术创新与感染精准医疗,是国内首家拥有病原宏基因组学(mNGS)诊断与基因编辑工具(CRISPR)快速诊断两大核心技术平台的企业。
近日,《病原精准诊疗前沿》栏目专访微远基因创始人兼首席技术官许腾博士,探讨微远基因在病原精准诊断领域的技术创新与临床应用。
多元化人才布局,聚焦病原诊断创新
微远基因成立于2018年,由李永军、王小锐和许腾博士三位共同创办。自成立起,微远基因一直把技术创新和产品开发的能力作为企业的立足之本,高聚焦、高投入,并聚集了一批病原学、宏基因组学、计算生物学等领域的高素质人才。
许腾表示,公司现有员工约500人,其中研发团队的硕博士占比高达50%,核心成员来自海内外**院校、知名体外诊断公司和基因行业领军企业。 微远搭建了一支多元化的研发团队,通过分子生物学、微生物学、计算生物学、流体力学等多学科综合,聚焦于病原感染诊断技术创新,解决了一些固有难题,保持在技术上的持续领先。像微远自主研发的专利病原富集技术PathoNET™技术和捕获宏基因组学新产品IDseq™Ultra等多个创新技术,也由此得以碰撞产生。
新一代捕获宏基因组学,推动病原精准检测升级
近年来,国家愈发重视病原体的精准检测能力。对未知或疑难病原微生物的检测,仍是传统检测难以越过的障碍。病原宏基因组(mNGS)检测,无需假设,无需培养,无偏好性,可直接提取临床样本的核酸进行高通量测序,经过病原数据库比对与生信分析,一次性完成病原体检测,能更好地满足临床需求。
许腾表示,2019年底的武汉新冠病例就是一个例子。微远基因运用基于mNGS技术的创新IDseq™产品,参与了新冠病毒最早期的发现与鉴定工作。“一网打尽”的IDseq™,无需培养,直接对样本中的病原体核酸进行高通量测序和鉴定,实现了对当时仍是“未知病原”的新冠病毒的早期预警。
病原宏基因组学技术的两个主要挑战:**,宿主干扰巨大,影响病原检出;第二,高质量的病原数据库构建难度大,不能仅使用公共数据库,而要靠中国特征临床大数据的积累。针对这些技术难点,微远基因经过三年,15万+大样本数据的积累,成功研发了病原反向富集、中国病原特征数据库等一系列创新技术,近期更是首次推出了基于百万定制病原探针的新一代捕获宏基因组学产品IDseq™Ultra,该技术极大的降低宿主核酸干扰,将病原检测灵敏度提升了两个量级(约100倍),也推动了病原宏基因组学从血浆检测到全血检测的转变。
多平台组合,搭建病原精准诊断整体方案
“实现精准病原诊断,仍需行业的共同努力。目前,我们常常仍在试图回答两个最基本的问题:是感染,自身免疫病或其他疾病?是什么病原体?”而对病原的毒力、药物反应、宿主反应、病人预后等问题仍难有答案。许腾表示,这也是微远探索和布局的方向。
尽管病原宏基因组学应用于感染诊断有其独特优势,前景广阔,但也存在局限和挑战。一方面,整体检测周期虽短于培养,但与PCR等技术相比仍较长。经过全流程优化后,微远能够实现隔天晨查房出检测报告;第二,技术操作较复杂,真正的全流程自动化处理仍未能实现,要避免为提高自动化程度而牺牲检测性能(如无法去除人源rRNA)。目前,模块式自动化是实现性能与自动化平衡较好的模式。
多平台互补,为病原检测的多个应用场景,如常规感染、急重症、疑难感染、传染病等形成全面解决方案,将是精准检测领域的发展方向。理想的病原检测产品体系应能应用于多个场景,是通过多技术组合,为病原检测提供一个整体解决方案。许腾补充说,微远基因目前的布局以病原宏基因组学为主,同时涵盖CRISPR分子快速诊断等多个技术平台,力争为感染精准诊断提供更全面的分子生物学解决方案,“相信当我们能很好地回答上面这些感染问题的时候,会是病原精准医疗真正到来的时候”。
微远基因专注于基因技术创新与感染精准医疗,拥有两大核心技术:病原宏基因组学(mNGS)诊断与基因编辑工具(CRISPR-Cas12/13)快速诊断技术,已申请/获得发明专利30项,拥有软件著作权多项。
微远基因总部坐落于***科技企业孵化器广州华新园,已建成近5000㎡的研发中心,医学检验实验室和体外诊断试剂GMP生产基地,在北京,上海等多地设有分支机构和实验基地。目前,微远已为超过300家临床单位提供服务,获得了中国未来医疗服务100强、粤港澳大湾区生物科技创新企业50强等荣誉称号。
微远基因秉持“基因科技,无微不至”的企业愿景,践行“**,笃行,至臻,共赢”的企业文化。我们深深明了,每一份珍贵样本的背后,都有一位亟待救治的病患。