从PB收购浅析基因测序仪行业市场

SOUTHMED
2021-07-23

南方医学网讯:近日,Pacific Biosciences(以下简称PacBio)发布公告称与Omniome签署最终收购协议。根据该协议,它将收购总部位于美国圣地亚哥的Omniome公司。Omniome公司是一家致力于研发创新DNA测序平台的公司,于2013年由前Illumina雇员Kandaswamy Vijayan博士创建。该公司的创新技术是称为“Sequencing by Binding”(SBB)的新一代测序平台。按照公告,此次收购后“PacBio将成为**同时拥有高精度长读长和短读长测序平台的公司,且意义重大即“改变基因组学格局”。



是否因此改变基因组学格局暂不好说,但提到PacBio的收购,绕不开的是2018-19年轰动一时的Illumina12亿美元收购PacBio却最终无果的案子。作为测序行业的龙头老大,Illumina平台专注于短读长测序技术,可以满足大多数测序应用需求。而PacBio公司是单分子测序领域的佼佼者之一,Illumina正是相中PacBio在长读长上的潜力,因此提出收购以期实现短读长与长读长的整合。然而,英国监管机构出场提议阻止这场收购,原因是“保持该国以及全球测序市场的竞争”。最终,Illumina未能如愿,收购中止。


对于以上测序公司的角逐,胜负难言,但在测序史上定会留下浓墨重彩的一笔。下面我们对测序仪市场作一盘点,略作浅析。


测序技术是测序仪器的核心所在,迄今为止已历经四代发展。主要的是前三代测序技术:**代测序技术,即Sanger测序技术(双脱氧核苷酸末端终止测序法);第二代测序技术是当今主流技术,应用也最为广泛,最显著的特点就是高通量,主要代表有Illumina公司的Solexa和HiSeq技术,Life Tech公司的Solid技术和Roche的454技术;第三代测序技术也叫单分子测序技术,它解决了一代和二代在测序前的文库制备和PCR扩增步骤,代表有Pacific Biosciences公司的SMRT测序技术;第四代测序技术正向着测序仪器体积更小的方向发展,如Oxford Nanopore Technologies公司的MinIon纳米孔单分子测序技术,使得信号的捕捉不再依赖高速摄像机或者高分辨的CCD相机。


一、Roche 454 GS测序系统


2005年底,454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System(GS 20),被《Nature》杂志以里程碑事件报道,开创了边合成边测序的先河。


2007年,Roche收购454,推出了性能更优的第二代基因组测序系统——Genome Sequencer FLX System,极大的提升测序通量和准确性,也进一步增加了测序读长。


2008年10月,454推出了全新的GS FLX Titanium系列试剂和软件,让GS FLX的通量一下子提高了5倍,准确性和读长也进一步提升。


虽然454具有读长优势,但是测序通量和成本始终限制了454平台的推广,因此Roche在2016年底终止了454 NGS测序相关的业务。


数据来源于Roche官网和网络


二、Illumina测序仪


2006年,Solexa公司推出了Genome Analyzer系统(简称GA),其包括DNA簇(DNA cluster)、桥式PCR(Bridge PCR)和可逆阻断(Reversible terminator)等核心技术,综合以上技术测序,GA系统在高通量、低成本、应用范围广等方面具有明显优点。


2007年,Illumina用6亿美金收购了Solexa,并在随后几年间发布了多种测序仪,主要包括两类:低通量的桌面式测序仪和高通量台式测序仪,基本覆盖行业内的各种测序应用,目前占据的测序市场份额超8成。Illumian公司系列测序仪参数对比下表所示:


数据来源于Illumina官网


三、Thermo Fisher体系测序仪


2008年ABI与Invitrogen合并成为Life technologies公司;


2010年8月,Life Technologies收购Ion Torrent(454   Life Sciences的创始人Jonathan Rothberg创办的);


2013年,Life Technologies被Thermo Fisher收购,借此Thermo Fisher正式入驻测序行业,旗下测序体系包括ABI SOLID和Ion-Proton两种平台。Thermo Fisher体系测序仪参数对比如下表:


数据来源于Thermo Fisher官网和网络


四、华大智造测序仪


2013年3月18日,华大基因全额收购美国Complete Genomics(CG),开启了华大测序仪之路。


2015年,华大推出**代BGISEQ-500测序仪,将人类基因组测序成本降到600美元。之后又推出的BGISEQ-50、MGISEQ-200和MGISEQ-2000均取得了CFDA认证;


2018年,华大又推出了T7测序仪,这款仪器一天就能完成60个人类基因组测序,是当今全世界公开发售的通量最高的测序仪。华大智造测序仪参数对比如下图所示:


数据来源于华大智造官网


小结


基因测序仪是基因检测行业的核心工具,但随着新工具和方法的升级迭代,其成本和测序周期已经从90年代人类基因组时代的十三年30亿美元测基因组,到了现在的24小时500美元。基因测序是精准医疗的重要一环,市场发展前景光明,未来可期。根据BBC Research预测,2018-2023年间全球基因测序市场规模增速在20%左右,预计到2023年,全球基因测序市场规模将达到250亿美元。那么拉长时间来看,或许测序市场的精彩才刚刚开始。


参考资料

[1]   Pacific Biosciences签署最终协议收购Omniome

[2] 12亿美元收购受阻!英国监管机构提议阻止Illumina收购PacBio,以保护英国及全球测序市场竞争

[3]   一文看全!史上以来的59家测序仪公司

[4]   全球精准医疗行业发展前景预测与投资战略规划分析报告





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